میکروسکوپ وارونه در شرایطی مانند زمانی که نیاز به دستکاری نمونه ها داریم یا در مواقعی که به فضای بالای نمونه احتیاج است مثلاً برای بازوهای میکانیکی و ابزارهای کوچک نگه داری و دستکاری نمونه، در برنامه های کاربردی وابسته به فن استخراج و ذوب فلزات استفاده می شود. به صورتی که عملیات روی نمونه در محلی بالای صفحه انجام گیرد تا برای عدسی های شیئی که زیر نمونه اند، قابل رویت باشد.